Озеро Когояр находится на левобережье, на территории двух республик Чувашской и Марий Эл, в 17 км к северо-западу от г. Чебоксары и в 4 км к северо-западу от пос. Северный.
Озеро Когояр имеет неправильную овальную форму, слегка оттянутую с юго-запада на северо-восток. Площадь водного зеркала на период обследования 1981 год составляла 58,8 га.
Максимальная длина озера - 1080 м, наибольшая ширина - 720 м. Длина береговой линии - 2900 м.
Глубины озера изменяются в значительных пределах: от 0,5-1,0 м у берегов до 8,0м в северо-западной части озера. Средняя глубина озера составила 2,9 м.
Абсолютная отметка уреза вода 81,3 м.
Береговая линия слабо изрезана, плавная в западной части, она имеет небольшую изрезанность в восточной и северо-восточной частях.
Рельеф дна озера характеризуется постепенным нарастанием глубин воды его прибрежных частях и их дальнейшим увеличением к центру водоема.
В целом рельеф дна озера достаточно ровный. Максимальные глубины установлены в северо-западной части водоема.